Ngày 7-3-2013, ĐSVN đã ban hành Chương trình hành động với mục tiêu: tạo sự thống nhất của các đơn vị trong toàn ngành đối với việc quán triệt và cụ thể hóa những nhiệm vụ đã được xác định trong các Nghị quyết 01/NQ-CP, số 02/NQ-CP của Chính phủ nhằm đề ra các biện pháp tích cực tháo gỡ khó khăn, giải quyết nợ xấu, thúc đẩy sản xuất kinh doanh, thực hiện tái cơ cấu nâng cao hiệu quả hoạt động và tăng tính cạnh tranh của doanh nghiệp; thực hiện tốt công tác an sinh xã hội; giữ vững ổn định chính trị, an ninh trật tự, quốc phòng quân sự và an toàn các mặt sản xuất; nâng cao hiệu quả hoạt động đối ngoại và hội nhập quốc tế để thực hiện tốt kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội năm 2013.

Theo Chương trình hành động, ĐSVN giao nhiệm vụ triển khai thực hiện cho các cơ quan, đơn vị thuộc ĐSVN tập trung trọng tâm vào các giải pháp chỉ đạo, điều hành, tổ chức thực hiện thắng lợi các mục tiêu, nhiệm vụ chủ yếu. 

Về vận tải, phấn đấu tấn xếp hàng hóa tăng 3%, T.Km tăng 4%, doanh thu tăng 6% trở lên so với năm 2012; hành khách lên tàu tăng 3%, HK.Km tăng 4% và doanh thu tăng 6% trở lên so với năm 2012; T.Km tính đổi tăng 4%...

Về an toàn GTVTĐS, phấn đấu giảm ít nhất 7% so với cùng kỳ năm 2012 ở cả 3 tiêu chí: số vụ tai nạn, số người chết, số người bị thương; không để xảy ra tai nạn đặc biệt nghiêm trọng và thiệt hại về người do chủ quan gây ra. Tiếp tục triển khai Kế hoạch lập lại trật tự hành lang an toàn GTVTĐB, ĐS theo Quyết định 1856/QĐ-TTg ngày 27-12-2007 của Thủ tướng Chính phủ giai đoạn II và III. Ưu tiên triển khai thực hiện các công trình, dự án được đầu tư nhằm bảo đảm an toàn GTĐS, đưa các công trình vào khai thác theo đúng tiến độ đề ra đặc biệt là các công trình theo lệnh khẩn cấp của Chính phủ…

Về công tác duy tu sửa chữa thường xuyên, định kỳ KCHTĐS, hoàn thành khối lượng và giải ngân hết 1.782,4 tỷ đồng trong kế hoạch vốn sự nghiệp kinh tế được nhà nước giao để củng cố kết cấu hạ tầng, giảm xóc lắc, giữ vững trạng thái chất lượng KCHT ĐS, đảm bảo chạy tàu êm thuận, an toàn và đáp ứng tốt nhất yêu cầu của khai thác vận tải trên toàn tuyến...

Về xây dựng cơ bản, phấn đấu hoàn thành kế hoạch vốn nhà nước giao, trong đó giải ngân hết 1.842,5 tỷ đồng vốn đầu tư phát triển. Đẩy nhanh tiến độ hoàn thành các dự án đã được bố trí vốn để sớm đưa vào khai thác phát huy hiệu quả đầu tư.

Về công nghiệp, phấn đấu giá trị tổng sản lượng và doanh thu tăng trên 3% so với năm 2012; hoàn thiện, đổi mới dây chuyền, công nghệ sản xuất quan tâm đầu tư nhân lực và thiết bị, công nghệ mới nhằm tăng năng suất lao động...

Ngoài ra, Chương trình hành động còn nêu các nhiệm vụ cụ thể trong các lĩnh vực khác như: công tác xây dựng kế hoạch, quy hoạch và các đề án khác; công tác sắp xếp đổi mới doanh nghiệp; quản lý nguồn vốn nhà nước, vốn của ĐSVN và huy động vốn; công tác kiểm tra, thực hiện Luật Phòng chống tham nhũng, Luật Thực hành tiết kiệm, chống lãng phí; công tác cải cách hành chính và xây dựng văn bản pháp quy trong nội bộ ĐSVN; công tác KHCN và giáo dục đào tạo; công tác bảo vệ môi trường, sử dụng năng lượng tiết kiệm, hiệu quả, ứng biến với biến đổi khí hậu, hỗ trợ người khuyết tật, người cao tuổi tham gia giao thông; công tác hợp tác quốc tế v.v…